清华大学目前有16个院系、38个本科专业招收外国留学生本科生。本科生学制为4年（建筑学专业为5年、生命科学—医学药学实验班为8年，获博士学位），采用中文或中英文双语教学。完成规定教学计划、考核合格并通过毕业论文答辩者，发给中英文毕业证书，并授予学士学位。
清华大学目前有32个院系的84个硕士专业和64个博士专业招收外国留学生，其中有10个专业开设了全英文硕士项目。攻读硕士学位的留学生学习年限一般为二年至三年；攻读博士学位的留学生学习年限一般为三至四年。研究生修业期满，成绩合格并通过论文答辩者发给毕业证书，并分别授予硕士学位和博士学位。
除全英文硕士项目外，研究生项目一般采用中文或中英文双语教学。